Reaxys的检索及特点
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2011年10月 第31卷第1O期 ・现代情报 Journal ofModem Information Oct..20l1 Vo1.31 No.1O 业务研究・ Reaxys的检索及特点 宋玉梅 (南京大学图书馆,江苏南京210093) 【摘要]Rea)(ys是2oo9年1月Elseviex公司新推出的基于W曲的数据库。该数据库将著名的CrossFire Beilstein/C,azlin、 Patent Chemistry数据库整合在一个平台下。Reaxys为无机、有机金属化学扣有机化学的研究提供了一个有效地设计化合物合成路 线的工具.无论是界面还是功能均针对化学家们的使用习惯进行了全新的设计。本文详细介绍了该数据库的检索界面、检索方 法及检索特点。 [关键词]Reaxys;数据库;检索 DOI:10.3969/i.iSSN.1008—0821.2011.1O.037 [中图分类号]G250.74 [文献标识码]B [文章编号]1008—0821(011)10—0151—06 2The Retrieval and Cha_racteristic of Reaxys Song Yumei (Library,Nanj堍University,Nanjing 210093,China) [Abstract]Reaxys Wfl8 hunched in January 2009 a8 a I删web database by Elsevier.The famous CrossFire Beilsteird C,melin and Patent Chemistry Database were all integrated in this platform.Reaxys pmvides all et ̄cient synthetic route designing tool for ino ̄ie.organometallic chemistry and organic chemistry research.Both interface and functionality aIe designed for the use habits of chemists."lhe Search interface,the retrieval method and characters ofthe database were introduced in this paper. [Key words]Reaxys;datahose;rb ̄ege Reaxys是爱思维尔公司于2OO9年1月新推出的基于 Web的数据库。它将著名的CrossFire oiBlstdn/Gmelin、Patent 来源于著名的CressFire Boilstein数据库、CressFire Cmelin数 据库及Patent Chemsitry数据库。 CrossFire oiBlstein数据库来源于著名的《贝尔斯坦有机 Chemistry数据库整合在一个平台下,无论是界面还是功能 均针对化学家们的使用习惯进行了全新的设计,为无机、 有机金属化学和有机化学的研究提供了一个有效地设计化 合物合成路线的工具。与原有的CrossFire事实数据库相比, 化学手册》,为世界上最大的有机化学数值和事实型数据 库,覆盖的文献最早可回溯到l771年,所有的文档都经过 了严格的评估和同行评审。其主要原始数据的索引分为3 R棚 使用和管理更加方便,不需要用户另外安装客户端 软件,基于II)进行访问,用户只要在有效 范围内,均可 部分内容t化学物质部分包含有机化合物的结构式信息及 其所有相关科学事实和数据,包括所有相关化学属性数据、 以登录系统,且无并发用户。 物理属性数据、生物活性数据(详细的药理学、环境病毒 学、生态学等含信息资源);反应信息部分收录超过1 000 万条有机反应式,详细记载了化合物的制备,包括反应物 1 RERxy¥的数据资源 平台整合了超过2 8007Y反应、1 8007Y物质及 400万文献的数据,且每年都在不断更新增加中。其数据 收稿日期i 2011—0g一05 及中间产物的合成路线、反应条件;文献部分包括近200 万篇引文、题录及文摘。 作者简介:宋玉梅(1980一),女,馆员,研究方向:信息检索及科学计量,发表论文2o余篇。 一15l一 2011年1O月 第3l卷第1O期 Reaxys的检索及特点 Oct.,2011 Vd.31/go.10  ̄ll'e Gme1iII数据库来源于《盖墨林无机与有机金 (Help),讯息(hfo)以及最右侧的注册、登 出。检 属化学手册》,为世界上最全面的有机金属和无机化学数据 库,包括可完全检索的化学结构和反应、相应的化学和物 理性质及文献,是这一领域惟一的大型数据库,覆盖了 索界面最下方的红字部分与一般网页相同包含数据商的联 系方式、Reaxys的相关信息、条款及条件、隐私权、 页面性能测试等。 通常用户第一次使用时先注册自己的账号,登录后对 1772年至今的文献。其数据来源于Graelin I-Iandlx ̄k of Inor- s ̄mie and Organometallic Chemistry(1772—1975),以及175 9账户进行设定。Reaxys本身默认的图形编辑工具是 ChemAxon MarvinSketeh,同时还提供其他5种不同的绘图工 年以后的主要材料科学期刊。Cross Fire Gmelln目前收集有 140万个化合物,包括如下各种类型:配位化合物、合金、 具,其中的Symyx ISIS Draw和c锄bIid宅9es0fI Cll锄Dr跏两种 固溶体、玻璃与陶瓷、高分子、矿物。 是国内用户经常使用的化学绘图软件,用户可通过红色链 Patent cll嘶数据库选自1869—1980年的有机化学 接去Reaxys的相关网站下载安装,并下载安装相应的结构 专利及1796年以来的约340 O0o篇有机化学和生命科学专利 编辑器插件(Reaxys Structure Editor Plush)。账户设定中用 (国际、美国和欧洲)。涵盖的专利类别有:C07(有机化 户还可以对结构显示、反应检索、物质检索及每页的显示 学),A61K(药物,医药,牙医,化妆品制备),A01N生物 条目进行不同情况的限定(笔者推荐使用默认值,因为在 杀灭剂(农用化学品,消毒剂等)C09B(染料,可能具有 检索界面中有相同的限定选择,局时可以根据检索结果具 药理学活性)。数据库包含了超过150万个化学反应,160 体情况限定)。另外,用户还可以根据自身的喜好设定检索 多万个有机、无机、金属有机化合物和聚合物及相关的数 结果中结构(咖Jctl )及文本/数据(Text/Data)高亮显示 据。 的颜色。当然,用户设定中也提供对个人信息和登录密码 的修改。 3 Reaxys的检索【Query) 连接网络打开 ̄https://www.reaxys.coln 即进入 的检索界面。nP_.ax ̄8的检索界面简洁、友好,其导 Reaxys提供反应检索(Reactions)、物质/性质检索 航栏包括以下几部分:查询(Queyr),结果(Results),合 (Substances and Propcai ̄s)及文献检索(Text,Authors and 成路线设计(SyI吐lleBis Hans),检索历史(History),我的提 More)三大检索方式,对应于 导航栏下的3个按钮 示(My Alerts),我的账户设定(My Se嘧 ),帮助 (如图1)。 图1 Reax ̄的(反应、物质/性质)检索界面 ・--——152・—-—— 2011年10月 现代情报 Oct.。2011 第31卷第1O期 Journal of Modem Information V01.31 No.10 点击“Reactions”或“Substances and Properties”按钮即 统名或俗名、InCH—Key、GAS登记号及Smile号等相关信 可进行反应或者是物质/性质检索。Reaxys的反应检索和物 息得到查询化合物的结构后完成反应检索或物质/性质检 质/性质检索均为图形结构检索方式(检索界面如图1)。 索,这一功能对于结构复杂的化合物(如天然产物、生物 双击结构检索框进入图形编辑界面绘制查询结构或反应。 碱等)及其相关反应的检索显得尤为方便,不再需要绘制 在进行反应检索和物质/性质检索的同时不但可以通过检索 其复杂的结构,只需输入其简单相关信息得到结构即可查 框右侧2个方框中的限定条件对检索进行限定,而且还可 询。 以通过检索框下对应的反应数据(Reaction Data)/物质数 点击“Text,Authors nad More”按钮即进入Reaxys的文 据(subst跚ces Chta)和书目数据(Bibliographic Data)对检 献检索界面,其包含表格检索和高级检索。表格检索提供 索结果进行限定。Reaxys反应检索和物质/性质检索的亮点 快速查询(支持布尔逻辑算符AND,OR,PROXIMITY, 在于两者可以通过检索框中的c ̄opy to substances tab或者是 NEAR andNEXT等检索命令),作者或发明人(Autilom/As. copy to reactions tab进行切换,另外在进行反应检索或物质/ signee)、期刊名(Journal Title)、专利号(Patent Numt ̄r)、 性质检索前可以通过结构检索框上的物质名称查询结构 专利国(Patent Country)及出版年(Publication Year)等6个 (Generate Structure from r蛐le)-2J按钮直接输入待查物质的系 检索点。 eaxys・ 图2 R唧s的文献检索界面 Reaxys的检索界面最下方3个按钮分别为清除查询 得到辛可宁定的结构,进入到Reactions或subsla嗍and (Clear Query)、下载查询(Load Query/Batch)、保存查询 Proeprtise的检索框,以系统限定默认值点击“search”检 (Save uQery)。值得强调的是下载查询Batch的使用,不管 索。 是图形格式查询还是文本格式查询通过Save Query到本机 Reaxys统一采用表格形式显示检索结果,表格的最左 任何位置,均可以随时打开文件再次查询,Reaxys可以瞬 侧filter by中是对显示结果的各种二次限定。每条显示结果 时识别保存文件中的查询内容。 前的小方框用于勾选文献,点击上方的“limit to”即显示 4 Reaxys的结果显示(Results)R输出(Output) 选定的结果。表格上方的放大镜提供显示结果放大缩小功 能。Reaxys对于显示结果还提供各种情况的排序,不同的 “反应检索及物质/性质检索”的检索结果以生物碱辛 检索方式分别按显示结果内容提供不同的排序方式。 可宁定(cinchonidine)检索为例,通过物质名称查询结构 Reaxys对检索结果限定处理的每一步都在导航栏与结果显 一153— 2011年1O月 第31卷第10期 Reaxys的检索及特点 Oct.,2011 、 01.31 No.1O 示表格间以方框形式一步一步的表现出来,通过点击方框 相关文献),部分化合物结构式下方还有emoleeules及dis. eoverygate的链接,从emoleuloes可了解化合物的价格及供货 商信息,从Discovery(ate链接到化合物的各类信息(I)iso . c ̄/Gate是一个强大的基于web的化学信息平台,它对各类 信息进行整合、索引并相互链接,使研究人员可以从一个 单一的入I:l迅速访问到化合物及相关的数据、反应、原始 文献和专利、以及合成方法学的权威参考著作)。 ̄ltiol1'8 结果显示切换至Citations结果显示,显示结果表格中包括 可以回到任何一个结果显示步骤,利于用户对检索结果限 定后的数据再加工。 反应检索显示结果提供Reactions、Citations两种显示页 面切换形式。显示结果表格最上方的黑体字“184 reactions out of141 citations”显示184个反应来自于141篇文献。Re。 aetiom的显示结果表格中每篇文献中的反应式显示在最上 方,其中对应的反应产率,反应发生的条件及反应的具体 文献出处3个栏目列于反应式下方。每个物质结构的下方 文献题名(Title of the Document)、作者(Authors)、出版年 (Year)、期刊卷期页码(sou )、被引用情况( nm鸭cited) 等栏目。 均有一个灰色的表格图标‘目”(点击显示化合物的相关 信息以及进一步操作)、放大镜图标(点击放大显示该化合 物三维结构)以及可链接的synthesis(点击显示该物质合成 图3反应检索显示结果界面 物质/性质结果显示提供 )st;m嘴(Grid)、Sul ̄tanees (table)及Citations 3种显示页面切换形式。显示结果表格 的最上方黑体字“625 81J]36tglIPA ̄out of 1157 citations”显示 625个物质来自于1157篇文献。Sustanees(Grid)中每个格 子中显示一个物质,每个物质结构下方图标均与Reacifom 与反应检索和物质/性质检索给出的结果显示一致。 结果显示的优点在于提供大量的高亮超链接。 例如:每篇文献的文摘,文献被引用情况均与Elsevier公司 的Seopus数据库实现无缝连接;与ernolecules及diseoverygate 信息平台实现链接。Reaxys结果显示的优点还在于通过各 种检索方式检索出的反应、物质/性质及文献在显示结果界 面可以互相切换,便于用户有选择的流阅。例如:点击物 质检索显示结果中该物质合成反应文献数即可显示该物质 显示结果中的一致。化合物结构式右边提供化学物质相关 信息的链接,点击每个链接均切换至Substances(table)页 面。Substames(table)显示结果表格包括化合物的结构 (Structure)、化学名称(Chemical Name)、合成该化合物的 文献数及反应总数(No of preparatiom All Preps lA1l Reac. tlom)、化合物相关数据(Available Data)、所有该化合物相 关文献数( ref.)、物质沸点(Boiling Point)等栏目。 的合成反应及文献信息。 Reaxys的结果输出,点击结果显示表格上方的“out— pt吐”或“print”,可输出选择限定部分及所有命中文献。输 出格式中有PDF、) 、WORD、EXCEL、Literature 叫Ige— itCations结果显示表格与反应检索中的显示界面一致。 文献检索结果显示提供Citations、Reaetiom、Substances rnent Systems(支持Reference 眦罾盯,Endnote等文献管理软 件)及RD File 6种选项。 (Grid)及Substances(Table)4种页面切换形式。显示内容 ——154—— ’ 2011年1O月 第31卷第l0期 Re ̄ys的检索及特点 的合成设计。 Oct。,2011 Vd.31 No.10 据用户习惯调整方向。Reaxys中Synthesis Plans的优点在于 用户可根据不同文献中给出的合成路线整合出新的可行性 国 l cl巍目国 1}} l口, {“~ 量 一 一 { j j je’0目日 冒臼00目囵 目冒 爨爨 型 璧兰 :=:} 鲤曼 一 0 00 ≯ 0∥ 叠 ≥00 ■0≯ 图5 S ̄theds 日璐树状合成路线图 有无Scopus的使用权。 6 嬲ys检索系统的主要特点 综合以上介绍,总结Reaxys有以下特点: (1)将传统客户端数据库升级为基于Web的数据库, (4)Reax ̄的Syntheais Plans功能为化合物的合成提供 更多可操作路线,为用户的研究创新提供有效途径。从检 索结果到决策辅助,从多步反应研究、反向合成分析到合 成路线设计,均可实现无缝对接。 (5)lteax ̄的绘图编辑软件及显示结果输出均提供多 样化的选择,既适应于用户的图形检索习惯,同时也方便 了用户对于最终数据的索取。 lteaxys数据库依据化学家的思考和工作方式而设计。 可以在最大程度上节省化学研究者收集信息方面所耗费的 时间与精力,把主要的精力投入到科研工作中去。其特色 检索界面简洁、使用方便。集合了传统数据库检索及网页 检索的优点,界面中的导航栏将数据库的各种使用功能直 接呈现于用户面前,符合当前网络用户的需求,更加的人 性化。 , (2)检索界面中的Generate Structure from TIaIIle、copy to substances tab及copy to reactions tab提供检索界面的切换均 为检索者省去检索上不必要的时间浪费,符合检索者的检 索习惯。检索界面中Load Q岫 B砒ll按钮将化学类数据库 检索中的图形及反应式检索通过编码的方式保存,便于再 和功能代表了当前化学文摘型数据库在网络环境下的发展 趋势,对化学文摘型数据库以及整个科技文献信息工作均 有很好的借鉴意义。 次检索时ReID 的瞬时读取。 (3)Reaxys结果显示中的大量超链接、检索过程的可 视化及无处不在的限定条件均为用户索取物质及反应相关 参[1] .reaxy8.o皤n[EB]. 考文献 信息提供了方便。超链接对于II'范围内可用相关资源均可 链接、同时可实现与Scoups数据库的无缝链接,不管该 【2]Goodman J. ∞驴[J].J ̄'rud 0f Chemical hlfam日li∞and Model- ,2009,(12):2897-2898. ・———156・———