靶向药物医保报销的比例各地区之间的差异较大，例如在北京医保报销80%，山东报销50%，沈阳报销30%。
新版的药品目录包括新增的36种谈判药品，其中，有15种是针对恶性肿瘤治疗的靶向治疗药品。涵盖肺癌、肝癌、乳腺癌、肾癌等多种恶性肿瘤疾病，靶向治疗药品治疗效果好、价格高。
靶向药报销比例如下：
1、恶性肿瘤靶向药物治疗获得慈善机构赠药前的费用，由城镇基本医疗保险统筹基金支付35%，城镇职工再由大额医疗保险支付35%，城镇居民则由大病保险再支付35%。
2、一个年度内支付的恶性肿瘤靶向药物治疗费用，不得超过年度最高支付限额。经批准转往区外定点医疗机构进行恶性肿瘤靶向药物治疗的，报销比例在原来报销标准的基础上从统筹基金中降低5%。
【本文所涉及的法律依据】：：
《中华人民共和国社会保险法》
第三十条
下列医疗费用不纳入基本医疗保险基金支付范围：
（一）应当从工伤保险基金中支付的；
（二）应当由第三人负担的；
（三）应当由公共卫生负担的；
（四）在境外就医的。医疗费用依法应当由第三人负担，第三人不支付或者无法确定第三人的，由基本医疗保险基金先行支付。基本医疗保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。