自然人独资公司转让股权的流程如下：
1、按照公司章程和法律规定签订股权转让协议；
2、公司注销原股东的出资证明书，向新股东签发出资证明书；
3、修改公司章程和股东名册，办理变更登记。
一、股权变更的流程是怎样的
股权变更的流程如下：
1、作出股东会决议并签署股权转让协议。
2、制作公司章程修正案。
3、到原公司登记机关办理股权变更登记手续。
二、股权转让是属于买卖合同吗
股权转让不属于买卖合同。股权转让合同与买卖合同的目的不同，股权转让合同的目的是转让股权，买卖合同的目的是促成消费。买卖合同是出卖人转移标的物的所有权于买受人，买受人支付价款的合同。
股权转让的流程有哪些
1、当事人达成股权转让的合意；
2、取得半数股东同意转让证明，以及其他股东放弃有限购买权证明；
3、签订股权转让协议；
4、注销原股东的出资证明书，向新股东签发出资证明书，并修改公司章程；
5、办理变更的登记。
股权转让需要什么材料
1、《公司变更登记申请书》；
2、《公司股东（发起人）出资情况表》；
3、《指定代表或者共同委托代理人的证明》及指定代表或委托代理人的身份证复印件；
4、有限责任公司提交股东会决议等。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国公司法》第七十三条
依照本法第七十一条、第七十二条转让股权后，公司应当注销原股东的出资证明书，向新股东签发出资证明书，并相应修改公司章程和股东名册中有关股东及其出资额的记载。对公司章程的该项修改不需再由股东会表决。