交通肇事罪不起诉会有案底，但具体情况而定。如犯罪嫌疑人没有违法犯罪事实，则不会有案底。但若因犯罪情节轻微或其他法定情形而不起诉，则仍会有案底记载。交通肇事罪已构成违法犯罪事实，因此即使不起诉也会有案底。酌定不起诉政审也不能过，不起诉决定应告知机关并记录在案。根据刑诉法规定，对于特定情况下的交通肇事罪，犯罪嫌疑人和被害人可以和解，机关和可提出从宽处理的建议。
法律分析
一、对交通肇事罪不起诉的规定
《刑诉法》第二百七十七下列公诉案件，犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪，通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，被害人自愿和解的，双方当事人可以和解：
（一）因民间纠纷引起，涉嫌刑法分则第四章、第五章规定的犯罪案件，可能判处三年有期徒刑以下刑罚的;
（二）除渎职犯罪以外的可能判处七年有期徒刑以下刑罚的过失犯罪案件。
第二百七十九条对于达成和解协议的案件，机关可以向人民提出从宽处理的建议。人民可以向人民提出从宽处罚的建议;对于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚的，可以作出不起诉的决定。人民可以依法对被告人从宽处罚。
二、酌定不起诉政审能过吗
酌定不起诉政审不能过。人民可以作出不起诉决定，不会判处刑罚，但是不起诉也应该告知承办案件的机关记录在案，且不论是酌定不起诉还是法定不起诉。
三、交通肇事罪不起诉会有案底吗
（一）交通肇事罪，是指违反道路交通管理法规，发生重大交通事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失，依法被追究刑事责任的犯罪行为。
（二）不起诉是否会有案底要视具体情况而定：
1、如果犯罪嫌疑人是因没有违法犯罪事实而被决定不起诉的，则不会有案底。
2、如果犯罪嫌疑人不是因没有违法犯罪事实而被决定不起诉，而且因犯罪情节轻微或具有《刑事诉讼法》第十五条规定的情形之一而被不起诉的，仍会有本应的案底记载。
（三）交通肇事罪已构成违反犯罪事实，所以不起诉也会有案底。
结语
根据《刑诉法》第二百七十七和第二百七十九条的规定，对于交通肇事罪的不起诉决定，可能会有案底记录。然而，具体是否有案底要视具体情况而定。如果犯罪嫌疑人没有违法犯罪事实而被决定不起诉，那么不会有案底记录。但如果犯罪嫌疑人因犯罪情节轻微或符合《刑事诉讼法》第十五条的情形而被不起诉，仍然可能有案底记载。因此，在交通肇事罪不起诉的情况下，可能会有案底记录存在。
法律依据
《中华人民共和国刑事诉讼法》
《中华人民共和国刑事诉讼法》第两百七十九条