合同双方当事人可以在合同中约定，发生纠纷时由哪个管辖;并且此种约定管辖优先于一般管辖。合同的双方当事人可以在书面合同中协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地人民管辖，但不得违反《民事诉讼法》对级别管辖和专属管辖的规定。
在约定管辖时应注意以下问题：
1、约定管辖的意思表示必须通过书面方式表达出来;形式可以是合同中的协议管辖条款，也可以是在诉讼前达成的选择管辖的协议。
2、选择的管辖的范围是限定的，即只能是在被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地人民中进行选择。
3、当事人选择的管辖必须是明确的。
4、约定管辖不得违反《民事诉讼法》对级别管辖和专属管辖的规定，如本应由中级人民管辖的案件就不能协议约定由基层人民管辖，本应由不动产所在地管辖的案件就不能协议约定由不动产所在地之外的管辖。
5、协议管辖必须采用书面形式。书面形式如合同中的条款、的协议书、信函、电报、传真、电子邮件等。双方若采用口头协议一律无效。
一、股权纠纷案件怎么管辖
按照我国《民事诉讼法》及最高院司法解释的规定，合同纠纷，由被告住所地或合同履行地人民管辖。如果合同没有实际履行，当事人双方住所地又都不在合同约定的履行地的，应由被告住所地人民管辖。同时，法律赋予当事人协议约定管辖的权利，即合同的双方当事人可以在书面合同中协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地人民管辖，但不得违反民诉法对级别管辖和专属管辖的规定。
在股权转让协议纠纷中，如果双方当事人对管辖有约定且约定有效的，应适用其约定；没有约定或约定不明，应适用法律规定，即由被告住所地或合同履行地人民管辖。
对于被告所在地，人们一般不会有歧义。而对于股权转让的合同履行地，应为股权转让的目标公司的公司注册地。因为，公司股权转让纠纷的特殊性在于转让行为需要向公司注册地的登记机关履行相应手续方可完成（如果是外资企业，在工商变更之前还需要商务主管部门的批复，否则股权转让合同不生效），因此，以公司注册地作为此类案件的管辖地也是国际上通行的做法。