在处理员工离职通知中，如果员工表达了对公司的不满或抱怨，管理者可以采取以下方法妥善处理：
倾听并理解：首先要倾听员工的不满或抱怨，了解其真实感受和想法，尽量理解其立场和情绪。
表达理解和同情：在回复离职通知时，可以表达对员工感受的理解和同情，让员工感受到被尊重和重视。
提供解决方案：尽量为员工提供解决问题的方案或建议，积极寻找解决办法，帮助员工缓解不满情绪。
提供反馈渠道：建议员工提供匿名反馈渠道，鼓励员工将不满或抱怨以建设性方式反馈给公司，帮助公司改进。
保持沟通：在员工离职后，仍可以保持与员工的沟通联系，了解其离职后的感受和想法，为未来改进提供参考。
案例分析：例如，某员工在离职通知中表达了对公司管理制度的不满，管理者可以通过与员工深入沟通，了解具体问题所在，并提出改进方案，如调整管理方式或制度，以平息员工不满情绪。