员工在非法经营中若知情并辅助公司，将以共同犯罪追究刑事责任。处罚包括五年以下有期徒刑或拘役，加上违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节严重者，将面临五年以上有期徒刑，加上违法所得一倍以上五倍以下罚金或财产没收。员工作为从犯，可根据法定量刑标准从轻、减轻或免除处罚。
法律分析
非法经营的员工如果知情并且辅助公司进行非法经营，按照共同犯罪追究员工的刑事责任。处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。员工一般构成从犯，按照法定量刑标准从轻处罚、减轻处罚或者免除处罚。
拓展延伸
员工非法经营罪的定性标准及法律适用
员工非法经营罪的定性标准主要依据国家相关法律法规进行判断。一般来说，员工非法经营罪的定性需要考虑以下几个方面：首先是行为要素，即员工是否存在非法经营行为，如未经授权擅自经营或利用职务便利从事非法经营活动；其次是主观要素，即员工是否具有故意或过失的主观故意；最后是客观要素，即员工的非法经营行为是否具备一定的社会危害性和违法性。根据法律适用，如果员工的非法经营行为达到了构成犯罪的标准，将依法追究其刑事责任；如果未达到犯罪标准，可能会受到行政处罚或民事赔偿等法律制裁。总之，员工非法经营罪的定性标准及法律适用是基于相关法律法规的规定和具体案件的事实依据进行判断和处理的。
结语
员工非法经营罪的定性标准主要依据国家相关法律法规进行判断。行为、主观和客观要素是判断依据。根据法律适用，构成犯罪将追究刑事责任，未达标准则可能受行政处罚或民事赔偿。员工非法经营罪的定性标准及法律适用基于法律规定和具体案件事实。
法律依据
《中华人民共和国刑法》
第二十七条在共同犯罪中起次要或者辅助作用的，是从犯。对于从犯，应当从轻、减轻处罚或者免除处罚。
第二百二十五条违反国家规定，有下列非法经营行为之一，扰乱市场秩序，情节严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产：
（一）未经许可经营法律、行规规定的专营、专卖物品或者其他买卖的物品的；
（二）买卖进出口许可证、进出口原产地证明以及其他法律、行规规定的经营许可证或者批准文件的；
（三）未经国家有关主管部门批准非法经营证券、期货、保险业务的，或者非法从事资金支付结算业务的；
（四）其他严重扰乱市场秩序的非法经营行为。