1.黄连素对心脏的抑制作用很强，镜面滴注降血糖，缓解心率失常时需要严格的控制剂量，以免引起心脏停止跳动，引发生命危险。
2.黄连属于大寒类中药，脾胃虚寒的患者不适合食用，可建议食用黄连素，代替黄连。
3.黄连素对胃肠道有一定的刺激作用，会促进胃酸的分泌，自身胃酸分泌较多者不适合食用。